Гражданская оборона Ханты-Мансийского автономного округа берет свое начало в 1980 году. Тогда, 19 сентября 1980 года на основании распорядительного документа Тюменского облисполкома № 012 был образован в Ханты-Мансийске Штаб гражданской обороны. Первым начальником Штаба ГО стал подполковник в отставке Николай Федорович Бабанов.
Выполняя задачи гражданской обороны, штабы ГО городов и районов, объектов народного хозяйства осуществляли комплекс мероприятий, направленных на подготовку к защите населения от опасностей, которые могли возникнуть при проведении военных действий или вследствие возникновения чрезвычайных ситуаций.
В 1991 году Указом Президента штабы ГО были переименованы в штабы ГО и ЧС, а в 1996 реорганизованы в Управления по делам ГО и ЧС.
В марте 2000 года Управление по делам ГО и ЧС ХМАО переименовано в Управление по делам ГО и ЧС при Правительстве Ханты-Мансийского автономного округа.А в августе 2004 года согласно Приказа МЧС РФ №372 "Об утверждении Положения о территориальном органе Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий» создано Главное управление МЧС России по Ханты-Мансийскому автономному округу - Югре.
Главное управление МЧС России по ХМАО - Югре сегодня - это организация, в ведении которой безопасность жителей округа, предупреждение и ликвидация любых чрезвычайных ситуаций, обеспечение пожарной безопасности и безопасности людей на водных объектах. В результате самоотверженной, настойчивой, слаженной деятельности всех подразделений Главного управления в округе создана и эффективно действует социально востребованная система предотвращения и ликвидации чрезвычайных ситуаций и стихийных бедствий.